Snabbfakta
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- Gif-sur-Yvette
Ansök senast: 2024-12-01
PhD in Structural Biology (M/ F)
Informations générales
Intitulé de l'offre : CDD Doctorant (H/F) en biologie structurale
Référence : UMR9198-FRAOCH-006
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : GIF SUR YVETTE
Date de publication : mardi 17 septembre 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 décembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2135,00 € mensuel
Section(s) CN : Biologie moléculaire et structurale, biochimie
Description du sujet de thèse
Ce sujet de thèse est financé par l'ANR. Il porte sur l’étude des mécanismes de réparation de l’ADN par recombinaison homologue dans le contexte de la chromatine et le design de peptides et peptidomimes inhibiteurs des interactions protéine-protéines dans ce contexte pour des applications en cancérologie.
Les cassures double brin de l’ADN induites par des irradiations ionisantes, des agents génotoxiques ou par le blocage des fourches de réplication de l’ADN doivent être réparées pour assurer la survie cellulaire. Cette réparation fait appel à des voies de réparation impliquant de nombreux acteurs dont les enzymes de réparation mais également des facteurs régulant l’accessibilité de l’ADN comme les chaperons d’histones. Ces voies constituent un ensemble de cibles potentielles pour éleimner sélectivement les cellules cancéreuses qui réparent moins efficacement ces cassures de l’ADN.
Le caractère innovant de ce projet réside dans la caractérisation des interactions entre les chaperons d’histones et les protéines de la réparation par la voie de recombinaison homologue et le design de molécules (peptides et peptidomimes) interférant avec ces voies pour des applications en cancérologie.
Les objectifs spécifiques de ce projet sont (i) caractériser le mode d’interaction entre les chaperons d’histones et des acteurs des voies de réparation de l’ADN (ii) concevoir et améliorer par voir rationnelle de ces peptides / peptidomimes interférant avec ces voies .
La réalisation de ce projet impliquera l'utilisation de méthodes de biologie structurale (cristallographie, RMN, cryo microscopie électronique) et de prédiction des structures (Alpha Fold, Rosetta). Le candidat(e) utilisera également des techniques classiques de biochimie des protéines, des méthodes de quantification des interactions (ITC, BLI) et la synthèse peptidique dans le cadre de la collaboration avec nos partenaires chimistes.
Contexte de travail
L'I2BC est une très grande unité mixte de recherche CNRS, CEA et Université Paris Saclay composée de près de 600 personnes. L'unité est constituée d’une soixantaine d’équipes de recherche réparties dans 5 départements scientifiques (Biologie des Génomes, Biologie Cellulaire, Virologie, Microbiologie, Biochimie/Biophysique/Biologie Structurale). Leur activité est soutenue par 17 plateformes technologiques de haut niveau et des services support et soutien mutualisés.
La/le candidat(e) sera intégré(e) à l'équipe "Assemblage moléculaire et Intégrité du génome" au sein du département de Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S) de l’I2BC. L'équipe est située au CEA Saclay et rejoindra un nouveau bâtiment de l'institut sur le campus de Gif-sur-Yvette courant 2025. L'équipe est composée de 10 personnes (2 DR CEA, 1CR CEA, 1MCU, 1 tech CEA, 2 IE, 3 doctorants).
Notre équipe combine des stratégies expérimentales et informatiques pour élucider les bases moléculaires qui sous-tendent l'assemblage dynamique de réseaux d'interactions protéiques spécifiques. En nous concentrant sur les complexes impliqués dans le maintien de l'intégrité du génome, nous caractérisons la structure des complexes, développons de nouvelles méthodes pour la prédiction de leurs conformations et concevons des composés inhibiteurs capables de perturber ces interactions.
La/le doctorant(e) sera formé(e) et encadré(e) par le directeur de thèse Francoise Ochsenbein. Elle/il bénéficiera de l'expertise en biochimie, biologie structurale et bioinformatique au sein de l'équipe. Elle/il aura accès aux formations et à l'équipement des plateformes de l'I2BC. Le projet sera mené en collaboration avec des équipes de chimiste de l’université de Bordeaux et des biologistes de l’institut Curie et du CEA Fontenay aux Roses Dans le cadre de collaborations ANR.
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