PhD student in cell biology M/ F

Informations générales

Intitulé de l'offre : Doctorant / doctorante en biologie cellulaire H/F
Référence : UMR7288-AUDBAR-038
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MARSEILLE 09
Date de publication : lundi 16 septembre 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 février 2025
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2135,00 € mensuel
Section(s) CN : Biologie cellulaire, développement, évolution-développement, reproduction

Description du sujet de thèse

Les équipes Schnorrer et Michelot cherchent un candidat /une candidate pour un poste de doctorant/doctorante international financé par le CNRS afin de comprendre comment l'évolution de l'expression des isoformes d'actine au cours du développement musculaire dirige l'assemblage et la maturation des sarcomères de la drosophile.

Contexte scientifique:
Les cellules musculaires contiennent initialement des filaments d'actine très dynamiques, puis assemblent des sarcomères contractiles stables à un stade défini du développement. Chaque sarcomère contient des filaments d'actine ordonnés et est relié mécaniquement aux sarcomères voisins pour former de longues chaînes périodiques . La séquence peptidique des isoformes d'actine musculaire présentes dans les sarcomères est très similaire à celle des isoformes d'actine non musculaire présentes dans les filaments dynamiques initiaux. Pourtant, ces deux isoformes d'actine ont des propriétés biochimiques différentes. Dans ce projet, nous voulons étudier pourquoi les différences moléculaires entre les isoformes d'actine conduisent à un changement radical de l'organisation et de la dynamique de l'actine dans les cellules musculaires. Nous voulons combiner la génétique de la drosophile et l'imagerie in vivo avec la biochimie de l'actine et l'imagerie de l'actine in vitro pour comprendre comment la chorégraphie moléculaire des composants conduit à l'assemblage des sarcomères dans les muscles.
Objectifs:
1. Caractériser les différences fonctionnelles entre les isoformes musculaires et non musculaires de l'actine de la drosophile en effectuant des permutations knock-in de leurs régions codantes par CRISPR et analyser les phénotypes musculaires résultants par microscopie confocale.
2. Manipuler la dynamique temporelle de régulateurs d'actine sélectionnés pour tester leur spécificité d'isoforme d'actine pendant l'assemblage du sarcomère in vivo.
3. Caractériser in vitro, en utilisant la polymérisation de filaments simples et la microscopie TIRF , les propriétés biochimiques des différents isoformes d'actine et leurs interactions avec des protéines de liaison à l'actine sélectionnées.
Votre profil :
Vous êtes biologiste, biochimiste, physicien, chimiste ou ingénieur et vous vous intéressez de près à la biologie quantitative. Vous êtes ambitieux, curieux, vous aimez apprendre de nouvelles techniques et trouver des réponses aux problèmes. Vous voulez profiter de l'opportunité de réaliser votre doctorat dans deux pays différents et d'apprendre de cultures et d'expertises différentes.

Contexte de travail

L'IBDM situé sur le Campus de Luminy, comprend environ 220 personnes titulaires Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Ingénieurs et Techniciens et non permanents CDD, Post doc, Doctorants, stagiaires répartis sur 21 équipes de recherches et 11 plateaux techniques et services.
L'IBDM est une unité mixte de recherche sous une tutelle du CNRS et de l'AMU, qui explore le domaine de la Biologie du développement et des pathologies qui y sont associées.
L'activité s'exercera au sein de l’équipe "Dynamique musculaire" dirigée par Franck SCHNORRER
Le laboratoire étant composé de plusieurs nationalités, la pratique de la langue anglaise est indispensable.
Ce projet interdisciplinaire est une collaboration internationale entre deux groupes basés à Marseille et à Singapour. Vous serez basé en France dans le groupe de Frank Schnorrer à l'Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM). L'équipe Schnorrer est expert en biologie musculaire et en imagerie in vivo. Les objectifs 1 et 2 seront réalisés à Marseille. Le groupe fait partie du Turing Centre of Living Systems (Centuri) qui rassemble des biologistes, des physiciens et des informaticiens. Vous bénéficierez donc d'un environnement interdisciplinaire, de collaborateurs, d'enseignements et de séminaires à deuxième base sera le groupe d'Alphée Michelot à l'Institut de mécanobiologie de Singapour (MBI) pour atteindre l'objectif 3. Le groupe Michelot est expert en biochimie de l'actine et en imagerie in vitro. Le MBI est un institut multidisciplinaire de premier plan qui se consacre au développement de nouveaux paradigmes pour comprendre les fonctions biologiques dans la santé et les maladies du point de vue de la mécanique/dynamique des cellules, des tissus et des organes et de la transduction des signaux mécaniques. L'institut fonctionne selon une philosophie de laboratoire ouvert entièrement intégré, avec une infrastructure étendue soutenue par des installations de base dédiées à des technologies telles que la microscopie optique de pointe, la nanofabrication et la microfabrication, et l'informatique.


Veuillez envoyer : Votre CV.

Contraintes et risques

Vous travaillerez avec des cultures de cellules bactériennes, des drosophiles, des produits chimiques, vous ferez de l'immunohistochimie et vous utiliserez des microscopes. Vous travaillerez aussi beaucoup devant des ordinateurs.