Postdoc on protein LLPS : Understanding the transition to amyloids through protein and water dynamics (M/ F)

Informations générales

Intitulé de l'offre : Postdoc sur la LLPS : dynamique des protéines et de leu eau d'hydratation pour comprendre la formation d'amyloides (H/F)
Référence : UMR5248-YANFIC-010
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : PESSAC
Date de publication : vendredi 4 octobre 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 18 mois
Date d'embauche prévue : 9 décembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2991 - 4166 € bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Chimie du vivant et pour le vivant : conception et propriétés de molécules d'intérêt biologique

Missions

La séparation de phase liquide-liquide (LLPS) de macromolécules biologiques permet de former des microréacteurs où les protéines sont localement concentrées. La LLPS peut également avoir une activité pathologique en favorisant l'agrégation amyloïde, qui est impliquée dans plusieurs maladies neurodégénératives. Aujourd’hui, les propriétés fondamentales des protéines en conditions LLPS sont mal caractérisées, et les processus conduisant les LLPS à former des amyloïdes sont inconnus. En particulier, l'eau d'hydratation joue un rôle clef dans leur séparation de phase et leur assemblage en amyloïdes pathogènes. Le but de ce projet est de comprendre comment la dynamique de l'eau et des protéines est perturbée par les LLPS et permet la formation d'assemblages amyloïdes. En particulier, nous étudierons les protéines intrinsèquement désordonnées tau et alpha-synucléine.

Activités

Dans ce projet, le (la) candidat(e) cartographiera entièrement la transition liquide-solide qui se produit lorsque les LLPS de tau et d'a-synucléine vieillissent. Ce processus de vieillissement dépend fortement des conditions expérimentales et représente le point de basculement entre les LLPS fonctionnelles et pathologiques. Le but du projet est de caractériser la dynamique des protéines et de leur eau d'hydratation au cours de ce processus de vieillissement. Le candidat combinera plusieurs méthodes biophysiques dont la fluorescence, la spectroscopie de résonance paramagnétique électronique (RPE) et la polarisation nucléaire dynamique Overhauser (ODNP). Le projet se déroulera en étroite collaboration avec deux équipes américaines (Santa Barbara et Boston) qui effectuent des simulations, ainsi qu'avec une équipe de l'ILL (Grenoble) qui réalise des expériences de diffusion de neutrons. Des déplacements sur ces sites sont prévus au cours de ce postdoc.

Compétences

Nous recherchons un(e) candidat(e) motivé(e) souhaitant élargir son expérience de recherche. Vous avez une forte compréhension de la séparation de phase liquide-liquide des protéines et une bonne connaissance des méthodes biophysiques. Un intérêt pour la science de l'eau est également essentiel. Il s'agit d'une excellente occasion de participer à un projet multidisciplinaire combinant la biochimie, la biophysique et la chimie physique. Le candidat retenu sera indépendant et s'épanouira au sein d'une petite équipe synergique.

Contexte de travail

Le poste est à pourvoir au sein du laboratoire CBMN (UMR5248) dans l'équipe de Y. Fichou (, situé à l'Institut Européen de Chimie et de Biologie (IECB) près de 'IECB est un institut pluridisciplinaire à l'interface de la biologie et de la chimie, et est équipé de plusieurs plateformes (biochimie, bactériologie, cristallographie, RMN, cryo-microscopie électronique) qui seront accessibles. Le projet est en collaboration avec le Prof. Shea à UC Santa Barbara, Prof. Straub à l’université de Boston et Prof. Weik, à l’université de Grenoble Alpes.